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【昊文章】鄭樹森院士團隊最新成果:GNA14高甲基化及其在HCC中的抑癌作用!

發稿時間:2021-04-02來源:天昊生物


一、數據分析發現GNA14作為HCC潛在甲基化相關的腫瘤抑制基因

為了獲得HCC最重要的潛在腫瘤抑制基因,作者分析了TCGAGSE94660中的mRNA表達數據及TCGADNA甲基化數據。從TCGA甲基化數據中獲得了535個差異甲基化基因(圖1A),TCGA表達數據中獲取了1088個在HCC腫瘤組織中顯著下調的基因(圖1B)。對三個數據集取交集發現了兩個重疊的基因GNA14TBX15(圖1C),GNA14表現出DNA甲基化水平上調(圖1D),而mRNA表達下調(圖1E),并且與HCC患者預后呈負相關,而TBX15并未顯示出這一結果。因此,選定GNA14作為HCC的研究對象。



二、GNA14HCC中表達顯著下調

為了確定GNA14HCC中的表達,利用qRT-PCR對收集的臨床配對樣本進行表達定量驗證,結果發現GNA14 mRNA表達在腫瘤組織中顯著下調(圖2A-B)。此外,多株HCC細胞系表現出GNA14 mRNA表達水平更低(圖2C)。多個配對樣本和細胞系的GNA14蛋白水平同樣顯著更低(圖2D-E)。ROC曲線分析GNA14在診斷TCGA數據庫(AUC = 0.948)和本院HCCAUC = 0.935)中表現出較好的靈敏度和特異性(圖2F)。免疫組化顯示與匹配的正常組織相比,腫瘤組織中GNA14表達降低(圖2G)。此外,GNA14的表達與臨床特征相關,在本院HCC標本中,HBV感染組織(4.55倍)和血管侵襲組織(2.63倍)中GNA14 mRNA表達顯著下調。在低分化組織(4.6倍)和復發患者組織(6.47倍)中,GNA14表達也顯著降低(圖2H